龟与鳖的呼吸器官主要是肺。但有时并不一定是用肺呼吸。龟的肺呼吸功能并不完全。所以有龟的咽气式呼吸。龟和鳖以颈和四肢的伸缩运动而产生呼吸,先呼气,后吸气,这种特殊的呼吸方式叫做“咽气式”呼吸,简称龟吸。我们应用医学解剖方法对实验龟进行分析,发现支气管不是逐级分枝进入肺组织,左右支气管直接大开口于肺的中央空腔,从网络面游离出来的小支报导管口开放,在中央空腔形成支气管大口对小口的特殊交换气体方式;薄层肺组织由细小支气管网络面支撑,悬浮于中央空腔和背甲下气囊之间,构成了龟的奇特呼吸器官.龟的颈部和四肢伸缩运动,实际不是压迫肺组织,而是压迫左右气囊,促使中央空腔的支气管进行气体交换。咽气式龟吸的基础是龟肺发育不良,气囊和中央空腔弥补了龟肺的呼吸功能。 龟与鳖的呼吸虽是以肺为主,但龟与鳖是一种变温的水生动物。到水温下降到12℃以下时就会本能地潜入深处冬眠。此时全靠辅助呼吸器官——鳃上组织获得水中的溶解氧维持生命。也就是说,龟与鳖除了在水温高和在陆地时用肺呼吸。在水中却是长时间地用辅助呼吸器官摄取水中的溶氧,向水中排出二氧化碳。
海龟是用肺来进行呼吸的,但它胸部不能活动,是一种吞气式的呼吸方式,每隔一段时间便要将头伸出海面来呼吸。但也可以比较长时间地在水下生活,因为它们都还有一种具特异呼吸功能的器官——肛囊,即直肠两侧的一对薄囊,在肛羹袋的壁上密布著许多微血管。当绿海龟在海中栖息时,能有节奏地收缩着肛门周围的肌肉,使海水在肛门、直肠和肛囊间进出,此时微细血管内的红细胞即可从海水中摄取氧气,不必把头伸出水面进行呼吸了。所谓的两栖动物,是指幼体和成体会出现较大形态上的变形,即“变态”。比如青蛙,呼吸系统就由蝌蚪的腮变成青蛙的肺。而海龟一生是不会发生上述变化的,所以不是两栖动物,而是爬行动物。
爬行动物本身也具有很多特点,主要是呼吸系统和循环系统上的。所以不能单就其能在水陆两地活动就认为它是两栖。