细鳞鱼除冬季外,基本不在死水和静水处停留,大都在急流、缓流中游弋觅食。封冻前部分细鳞鱼留守在小溪的深水里,大部分返回江河越冬。
栖息于水温较低的江河中,春季溯河游向上游,秋季向大江大河中迁移。性贪食,肉食性。摄食水生昆虫及幼虫。3龄于开始性成熟,生殖期在5~6月,在水流湍急、水深1~1.2米、水温7~8℃,水底为砂砾的产卵场产卵。卵沉性,卵径4.0~4.1毫米。
为冰期自北方南移的残留种。属冷水性山麓鱼类。生活于秦岭地区海拔900—2300m的山涧溪流中,除洪水期,很少在平原平流中见到。多在水流湍急、水质清澈、大型砾石底质的河段活动。最小性成熟年龄3+—5+龄。性成熟个体2—3月产卵,产卵场多在浅水砂石底处。产卵水温低于10℃。为肉食性鱼类,幼鱼主要以水生夫脊椎动物为食,成鱼除摄食鱼类外,也食被风吹落的陆生昆虫。